В связи с прекращением авиаперевозок и операционной деятельности авиакомпании, руководство ОАО "АК Трансаэро" было вынуждено провести сокращение персонала с полным соблюдением трудового законодательства РФ. Для координации всех мероприятий в авиакомпании была создана специальная комиссия. Число работников было уменьшено с 10637 до 239 сотрудников. Контролирующими органами не было выявлено ни одного нарушения в части проведенной процедуры сокращения персонала.
После того как 21 октября 2015 года Федеральным агентством воздушного транспорта РФ было принято решение об аннулировании с 26 октября 2015 года сертификата эксплуатанта ОАО "АК Трансаэро" и отзыве всех допусков на международные рейсы, компания прекратила полеты. В декабре 2015 года, по распоряжению генерального директора ОАО "АК Трансаэро" А.К. Бурдина сотрудникам авиакомпании были вручены уведомления о сокращении с 4 марта 2016 года. Данная мера была вынужденным шагом, поскольку на тот момент практически все сотрудники компании находились в простое по вине работодателя, а предпосылки для восстановления операционной деятельности отсутствовали. О массовом высвобождении персонала были своевременно уведомлены центры занятости в г. Санкт-Петербурге и г. Москве.
Для максимально эффективной организации работы Департамента персонала и Бухгалтерии ОАО "АК Трансаэро" по сокращению штатов была организована электронная запись работников на получение документов, обработку запросов и т.д. Совместно с органами центра занятости населения в г. Москве и г. Санкт-Петербурге, в регионах РФ проведена работа по информированию персонала о возможности получить дополнительные профессиональные навыки и профессию в центрах занятости населения за счет средств федерального и муниципального бюджета. Все мероприятия по выдаче документов при процедуре сокращения были проведены до 4 марта 2016 года на территории офиса ОАО "АК Трансаэро" в г. Москве.
«На протяжении всей процедуры сокращения персонала сотрудники Департамента персонала авиакомпании осуществляли постоянное взаимодействие с Федеральной службой по труду и занятости, а также Государственными инспекциями труда г. Москвы и г. Санкт-Петербурга, где были созданы специальные рабочие группы, – говорит Генеральный директор ОАО «АК Трансаэро» А.К. Бурдин, - В органы исполнительной власти еженедельно предоставлялись данные по увольнению сотрудников, ежедневно - необходимые документы и информация по запросам надзорных органов. По результатам проведенных проверок надзорными органами (в т.ч. Северо-Западной транспортной прокуратурой РФ) было установлено, что интересы работников ОАО "АК Трансаэро" были полностью соблюдены в рамках требований ТК РФ. Ни одного нарушения в части организации и осуществления процедуры сокращения не выявлено».
На момент прекращения авиаперевозок в штате ОАО "АК Трансаэро" было 10,6 тыс. человек. Отток начался в ноябре 2015 года, когда по собственному желанию уволились 1211 человек. В декабре 2015го, январе и феврале 2016го цифры сотрудников, которые уволились по собственному желанию составили 1561, 811, 789 человек соответственно. 4го марта 2016 года было сокращено 4623 человека, а по собственному желанию в марте 2016 года уволилось еще 29 сотрудников. С апреля 2016 года по н.в. из ОАО "АК Трансаэро" было уволено еще 210 человек – 114 по сокращению численности (штата) работников, 52 по собственному желанию и 43 человека по соглашению сторон. В настоящий момент в штате компании, кроме 239 работающих специалистов и 117 льготников, также числятся 990 сотрудников, которые находятся в отпуске по беременности и родам, а также в отпуске по уходу за ребенком.
На 1 сентября 2015 года у ОАО "АК Трансаэро" функционировал Центр по работе с представительствами, которому организационно подчинялись 19 зарубежных представительств и обособленных подразделений, в которых работало 172 человека. Наибольшее число специалистов было в Казахстане (45 человек), в Юго-Восточной Азии (17), на Украине (15), в Армении (10), Узбекистане (10), Австрии/Чехии (9), Израиле (9), Италии (8) и т.д. В настоящий момент все люди, кроме шести сотрудников льготных категорий, уволены по собственному желанию, соглашению сторон, сокращению или по факту ликвидации представительства.
Для наиболее эффективного трудоустройства по специальности тех сотрудников ОАО "АК Трансаэро", которые были уволены по сокращению штатов, по решению Генерального директора А.К. Бурдина, с декабря 2015 года по 28 марта 2016 года в офисе авиакомпании на ул. Мишина, дом 56 в г. Москве действовал специальный штаб по трудоустройству, куда были приглашены кадровые специалисты всех крупных авиаперевозчиков РФ. В рамках работы этого штаба осуществлялся плавный перевод сотрудников на аналогичные должности в другие авиакомпании России. Сотрудники Департамента персонала ОАО «АК Трансаэро» обеспечивали подбор кандидатов и оперативное оформление их перехода на работу. Благодаря высокой профессиональной подготовке бывших сотрудников ОАО "АК Трансаэро" (коэффициент SAFA в 2015 году улучшился в два раза и составил 0,32) и значительному опыту специалистов авиакомпании, значительная часть высвобожденного персонала нашла себе работу по специальности в группе компаний "Аэрофлот", ФГБУ "СЛО "Россия", ООО Авиапредприятие «Газпром авиа», ОАО Авиакомпания "Уральские авиалинии" и т.д. Наибольшая часть сотрудников была трудоустроена в АК "Россия" (группа "Аэрофлот") - 2351 человек.